Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms