Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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