Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms