Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps4Q99KG7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms