Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms