Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ophn1Q99J31 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms