Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trps1Q925H1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms