Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbox1Q924Y0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbox1Q924Y0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms