Protein–RNA interactions for Protein: Q923S9

Rab30, Ras-related protein Rab-30, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab30Q923S9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab30Q923S9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms