Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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