Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn1Q922Y1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms