Protein–RNA interactions for Protein: Q91YW3

Dnajc3, DnaJ homolog subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc3Q91YW3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc3Q91YW3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms