Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms