Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms