Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms