Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usb1Q91W78 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms