Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms