Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx9Q91VH2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx9Q91VH2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx9Q91VH2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx9Q91VH2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx9Q91VH2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx9Q91VH2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx9Q91VH2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx9Q91VH2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx9Q91VH2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx9Q91VH2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx9Q91VH2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx9Q91VH2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx9Q91VH2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx9Q91VH2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms