Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms