Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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