Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms