Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU1

Rhov, Rho-related GTP-binding protein RhoV, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhovQ8VDU1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhovQ8VDU1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms