Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VDP2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VDP2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8VDP2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8VDP2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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