Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Uhrf1Q8VDF2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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