Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms