Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2C8

Vmn1r18, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r18Q8R2C8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Vmn1r18Q8R2C8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Vmn1r18Q8R2C8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Vmn1r18Q8R2C8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Vmn1r18Q8R2C8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Vmn1r18Q8R2C8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Vmn1r18Q8R2C8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Vmn1r18Q8R2C8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Vmn1r18Q8R2C8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vmn1r18Q8R2C8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vmn1r18Q8R2C8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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