Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1N4

Nudcd3, NudC domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd3Q8R1N4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms