Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MyripQ8K3I4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms