Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nsl1Q8K305 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms