Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms