Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccm2Q8K2Y9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms