Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms