Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gtf3c1Q8K284 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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