Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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