Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacs1Q8K212 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs1Q8K212 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms