Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog3Q8CI04 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms