Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ercc8Q8CFD5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms