Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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