Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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