Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms