Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf20l1Q8CCJ9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms