Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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