Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf170Q8CBG9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf170Q8CBG9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms