Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms