Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8E0

Gm13199, Predicted gene 13199, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13199Q8C8E0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm13199Q8C8E0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm13199Q8C8E0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm13199Q8C8E0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm13199Q8C8E0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm13199Q8C8E0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm13199Q8C8E0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm13199Q8C8E0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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