Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nlrp4bQ8C6J9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nlrp4bQ8C6J9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nlrp4bQ8C6J9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nlrp4bQ8C6J9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nlrp4bQ8C6J9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nlrp4bQ8C6J9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nlrp4bQ8C6J9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4bQ8C6J9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nlrp4bQ8C6J9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms