Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TdrpQ8C5P7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms