Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ska3Q8C263 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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