Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C1R3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms