Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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Nek11Q8C0Q4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Nek11Q8C0Q4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Nek11Q8C0Q4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Nek11Q8C0Q4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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Nek11Q8C0Q4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Nek11Q8C0Q4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Nek11Q8C0Q4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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Nek11Q8C0Q4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek11Q8C0Q4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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